Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms