Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Mrpl39Q9JKF7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Mrpl39Q9JKF7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Mrpl39Q9JKF7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Mrpl39Q9JKF7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Mrpl39Q9JKF7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Mrpl39Q9JKF7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Mrpl39Q9JKF7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Mrpl39Q9JKF7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Mrpl39Q9JKF7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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