Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms