Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms