Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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