Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms