Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Caln1Q9JJG7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Caln1Q9JJG7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Caln1Q9JJG7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Caln1Q9JJG7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Caln1Q9JJG7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Caln1Q9JJG7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Caln1Q9JJG7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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