Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms