Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ccl28Q9JIL2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ccl28Q9JIL2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl28Q9JIL2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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