Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb1Q9JIF7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms