Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MkksQ9JI70 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MkksQ9JI70 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MkksQ9JI70 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MkksQ9JI70 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MkksQ9JI70 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MkksQ9JI70 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MkksQ9JI70 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms