Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ClpxQ9JHS4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ClpxQ9JHS4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms