Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHR9

Nrip2, Nuclear receptor-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip2Q9JHR9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nrip2Q9JHR9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrip2Q9JHR9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms