Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tssc4Q9JHE7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tssc4Q9JHE7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms