Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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