Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms