Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERZ3

Chrm3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm3Q9ERZ3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrm3Q9ERZ3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrm3Q9ERZ3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms