Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Erg28Q9ERY9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Erg28Q9ERY9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Erg28Q9ERY9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Erg28Q9ERY9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Erg28Q9ERY9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Erg28Q9ERY9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Erg28Q9ERY9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Erg28Q9ERY9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Erg28Q9ERY9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Erg28Q9ERY9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms