Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trhr2Q9ERT2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trhr2Q9ERT2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms