Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk3Q9ERH7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms