Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms