Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap29Q9ERB0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms