Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms