Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms