Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms