Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 464.5 ms