Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SyncQ9EPM5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncQ9EPM5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncQ9EPM5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncQ9EPM5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncQ9EPM5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncQ9EPM5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncQ9EPM5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncQ9EPM5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncQ9EPM5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncQ9EPM5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncQ9EPM5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncQ9EPM5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SyncQ9EPM5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms