Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Tspan4Q9DCK3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Tspan4Q9DCK3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tspan4Q9DCK3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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