Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne8Q9DC53 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms