Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syvn1Q9DBY1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syvn1Q9DBY1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syvn1Q9DBY1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syvn1Q9DBY1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syvn1Q9DBY1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syvn1Q9DBY1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syvn1Q9DBY1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syvn1Q9DBY1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syvn1Q9DBY1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syvn1Q9DBY1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syvn1Q9DBY1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syvn1Q9DBY1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syvn1Q9DBY1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syvn1Q9DBY1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syvn1Q9DBY1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syvn1Q9DBY1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syvn1Q9DBY1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syvn1Q9DBY1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms