Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Smg9Q9DB90 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Smg9Q9DB90 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Smg9Q9DB90 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Smg9Q9DB90 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Smg9Q9DB90 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Smg9Q9DB90 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Smg9Q9DB90 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Smg9Q9DB90 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Smg9Q9DB90 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Smg9Q9DB90 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Smg9Q9DB90 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Smg9Q9DB90 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Smg9Q9DB90 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Smg9Q9DB90 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Smg9Q9DB90 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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