Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms