Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cab39lQ9DB16 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cab39lQ9DB16 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cab39lQ9DB16 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cab39lQ9DB16 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cab39lQ9DB16 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cab39lQ9DB16 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms