Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmbim4Q9DA39 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmbim4Q9DA39 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms