Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms