Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms