Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sgf29Q9DA08 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms