Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D9D9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D9D9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D9D9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D9D9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Q9D9D9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D9D9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D9D9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D9D9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D9D9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D9D9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D9D9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D9D9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D9D9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D9D9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D9D9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D9D9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D9D9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D9D9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D9D9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D9D9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D9D9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms