Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Snx5Q9D8U8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Snx5Q9D8U8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Snx5Q9D8U8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Snx5Q9D8U8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Snx5Q9D8U8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Snx5Q9D8U8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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