Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo2Q9D8S4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms