Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d4aQ9D7V1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms