Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Borcs6Q9D6W8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Borcs6Q9D6W8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Borcs6Q9D6W8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Borcs6Q9D6W8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Borcs6Q9D6W8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Borcs6Q9D6W8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Borcs6Q9D6W8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Borcs6Q9D6W8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Borcs6Q9D6W8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Borcs6Q9D6W8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Borcs6Q9D6W8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms