Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat2bQ9D5U0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms