Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tomm20lQ9D4V6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tomm20lQ9D4V6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tomm20lQ9D4V6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tomm20lQ9D4V6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm20lQ9D4V6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms