Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ribc2Q9D4Q1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc2Q9D4Q1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms