Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lonrf3Q9D4H7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms