Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 350.6 ms