Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sohlh2Q9D489 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms