Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms