Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpn3Q9D3W4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpn3Q9D3W4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpn3Q9D3W4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpn3Q9D3W4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpn3Q9D3W4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gpn3Q9D3W4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gpn3Q9D3W4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gpn3Q9D3W4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms